已经认证的发票对方作废了还未抵扣怎么办

根据《国家税务总局关于修订<增值税专用发票使用规定>的通知》（国税发〔2006〕156号）的有关规定，所称作废条件：一、收到退回的发票联、抵扣联时间未超过销售方开票当月；二、销售方未抄税并且未记账；三、购买方未认证或者认证结果为“纳税人识别号认证不符”、“专用 码、号码认证不符”。纳税人将不符合作废条件的发票进行了作废处理，应各自及时向双方主管税务机关报告，按照主管税务机关的要求处理。

已经认证但未申报抵扣的专用发票对方作废了，购买方在申报当期增值税的时候自动把该张发票税额做进项税转出，其次，税务管理员会联系你，你需要和管理员解释一下，这个情况说明盖上公章交到管理员出（情况说明根据管理员要求提供）

已认证未抵扣的发票，购进方在申报时需要进项税转出，

已经认证的发票，对方作废了，需要做进项税额转出。
借：应交税金－进项税额转出
　　贷：应交税金－认证进项税
　　《增值税暂行条例》第十条规定，当纳税人购进的货物或接受的应税劳务不是用于增值税应税项目，而是用于非应税项目、免税项目或用于集体福利，个人消费等情况时，其支付的进项税就不能从销项税额中抵扣。
　　实际工作中，经常存在纳税人当期购进的货物或应税劳务事先并未确定将用于生产或非生产经营，但其进项税税额已在当期销项税额中进行了抵扣，当已抵扣进项税税额的购进货物或应税劳务改变用途，用于非应税项目、免税项目、集体福利或个人消费等，购进货物发生非正常损失，在产品和产成品发生非正常损失时，应将购进货物或应税劳务的进项税税额从当期发生的进项税税额中扣除，在会计处理中记入"进项税额转出"。
　　所谓增值税进项税额转出是将那些按税法规定不能抵扣，但购进时已作抵扣的进项税额如数转出，在数额上是一进一出，进出相等。而视同销售是指企业对某项业务未做销售处理，但按税法规定应视同销售交纳相关税费，需计算交纳增值税销项税额。
　　二者的区别主要在于:进项税额转出仅仅是将原计入进项税额中不能抵扣的部分转出去，不考虑购进货物的增值情况;视同销售销项税额是根据货物增值后的价值计算的，其与该项货物的进项税额的差额，为应交增值税。

和对方联系一下，会有办法解决的