3%。小规模纳税人开具或申请 的增值税专用发票，统一使用征收率（3%）为税率。所以农业公司一，般纳税人税率是3%。农业企业是指从事农、林、牧、副、渔业等生产经营活动，具有较高的商品率，实行自主经营、独立经济核算，具有法人资格的盈利性的经济组织。
