不适用征管法的税有：关税、船舶吨税以及海关代征的进口增值税、消费税。只有企业在进出口阶段才会涉及到关税和船舶吨税，征收部门当然是海关。在进出口阶段，企业除了要缴纳关税，还要缴纳增值税和消费税。海关阶段会涉及到的增值税和消费税也由海关征收。海关征收的这些税当然需要适用于海关法。
