一个增值税和营业税交叉的疑难问题

你说的兼营的问题，不是混合销售行为。
兼营首先要确定的是缴纳增值税还是缴纳营业税。然后再确定的销售情况。
混合销售行为是指在一项销售行为中，如果你销售货物又提供非应税劳务，应征增值税，如：你销售空调同时提供安装和售后服务，就要征增值税。反之如果你是做建筑安装业的同时销售铝合金门窗，应征营业税。
你把两个概念混淆了。

根据财政部《 人民共和国增值税暂行条例实施细则》（财法[1993]38号）的规定：
1、一项销售行为如果既涉及货物又涉及非应税劳务，为混合销售行为。从事货物的生产、批发或零售的企业、企业性单位及个体经营者的混合销售行为，视为销售货物，应当征收增值税；其他单位和个人的混合销售行为，视为销售非应税劳务，不征收增值税。
2、纳税人的销售行为是否属于混合销售行为，由国家税务总局所属征收机关确定。

根据国家税务总局《关于纳税人销售自产货物提供增值税劳务并同时提供建筑业劳务征收流转税问题的通知》（国税发[2002]117号）的规定：
1、纳税人以签订建设工程施工总包或分包合同（包括建筑、安装、装饰、修缮等工程总包和分包合同，下同）方式开展经营活动时，销售自产货物、提供增值税应税劳务并同时提供建筑业劳务（包括建筑、安装、修缮、装饰、其他工程作业，下同），同时符合规定条件的，对销售自产货物和提供增值税应税劳务取得的收入征收增值税，提供建筑业劳务收入（不包括按规定应征收增值税的自产货物和增值税应税劳务收入）征收营业税。
2、本通知中所称纳税人是指从事货物生产的单位或个人。

由此：

1、对于从事货物生产的单位和个人，“以签订建设工程施工总包或分包合同（包括建筑、安装、装饰、修缮等工程总包和分包合同，下同）方式开展经营活动时，销售自产货物、提供增值税应税劳务并同时提供建筑业劳务（包括建筑、安装、修缮、装饰、其他工程作业，下同）”（以下简称建设工程混合销售），同时符合“国税发[2002]117号”文规定条件的，分别征收增值税、营业税。

2、对于从事货物生产的单位和个人，其建设工程混合销售，不同时符合“国税发[2002]117号”文规定条件的，应当按照《增值税暂行条例实施细则》有关混合销售行为的规定，征收增值税。

3、对于非从事货物生产的单位和个人，其建设工程混合销售，仍应当按照《增值税暂行条例实施细则》有关混合销售行为的规定，征收营业税。

所以，“国税发[2002]117号”文的相关规定，其实是对《增值税暂行条例实施细则》中有关应当征收增值税的混合销售行为规定的一种“例外”、“豁免”。对于《增值税暂行条例实施细则》规定应当征收营业税的混合销售行为，不适用“国税发[2002]117号”文的相关规定，仍然应按《增值税暂行条例实施细则》的规定全额征收营业税，而不是全额征收增值税。