发票已认证但未申报抵扣，应该如何处理

根据《 国家税务总局 关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》（国税函〔2009〕617号）的规定，增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报 抵扣进项税额 。另外，根据《 国家税务总局 关于未按期申报抵扣增值税扣税凭证有关问题的公告》（ 国家税务总局 公告2011年第78号）的规定，增值税一般纳税人取得的增值税专用发票已认证或已采集上报信息但未按照规定期限申报抵扣，属于发生真实交易且符合本公告第二条规定的客观原因的，经主管税务机关审核，允许纳税人继续申报抵扣其进项税额。增值税一般纳税人除本公告第二条规定的客观原因以外的其他原因造成增值税扣税凭证未按期申报抵扣的，仍按照现行增值税扣税凭证申报抵扣有关规定执行。客观原因包括如下类型：⑴因 自然灾害 、社会突发事件等不可抗力原因造成增值税扣税凭证未按期申报抵扣；⑵有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押、封存纳税人账簿资料，导致纳税人未能按期办理申报手续；⑶税务机关信息系统、网络故障，导致纳税人未能及时取得认证结果通知书或稽核结果通知书，未能及时办理申报抵扣；⑷由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致未能按期申报抵扣；⑸ 国家税务总局 规定的其他情形。

请及时提醒外贸企业操作时慎重勾选“用于进项抵扣”（确认用于内销的除外），经与总局确认，升级后的系统在勾选之后，无法进行用途变更，也就是说勾选“进项抵扣”后无法再用于申请出口退税，（即使再做进项转出，出口退税审核系统也无相关发票信息）。依据“进项税额已计算抵扣的增值税专用发票，不得在申报退（免）税时提供”。【摘要】
已认证的增值税专用发票未申报怎么办?【提问】
您好，我是律临平台合作律师，很高兴为您服务【回答】
已经进行退税勾选的发票，在90天以内还没有申报退税怎么办【提问】
亲亲，如果是联网报税的,已经认证的增值税票已经在网上开票系统里,不需要自己录入;如果的手工帐或电脑帐里没有的话只需要调整会计帐的,可以咨询当地国税局的办税员协助处理。当月认证的增值税专用发票当月必须申报抵扣,否则以后月份不允许抵扣。【回答】
我上述给您的回答，您有时间的话可以看一下的哦，如果有不明白的地方，咱们再交流沟通，我继续为您解答【回答】
弘扬法治精神，维护公平正义，彰显人文价值，现在是法治社会，您的权利受到损害的话，您是可以通过正当途径来维护您的合法权利的哦【回答】
您可以咨询当地国税局的办税员协助处理。当月认证的增值税专用发票当月必须申报抵扣,否则以后月份不允许抵扣。【回答】
感谢您的咨询，祝您生活愉快【回答】
我说的是退税勾选【提问】
请及时提醒外贸企业操作时慎重勾选“用于进项抵扣”（确认用于内销的除外），经与总局确认，升级后的系统在勾选之后，无法进行用途变更，也就是说勾选“进项抵扣”后无法再用于申请出口退税，（即使再做进项转出，出口退税审核系统也无相关发票信息）。依据“进项税额已计算抵扣的增值税专用发票，不得在申报退（免）税时提供”。【回答】
亲亲，如果已经勾选过了，但是没有及时申报，跟税务局说明情况进行补充申报即可【回答】

那就申报抵扣就是了