关于增值税的几个问题

首先你的假设就不成立，因为一般纳税人可以做进项税额抵扣，所以他的进货价没有那么高。
其次：你的问题是利润高低对税收的影响。流转税不是针对利润收的所以它的税负当然跟利润没有关系的。
跟利润有关的是所得税
同样的企业销售不同利润的产品它的利润的不同，而所得税就不同，利润高的所得税高，利润低的所得税低，

一般纳税人与小规模纳税人的差异：国家税收法律鼓励企业通过自身会计制度的不断健全来建立真实可靠而合法的会计帐，从而通过一般纳税人认定，但是大多数企业都是帐证不健全的，为此国家税收法律是这样的，正规的企业帐健全的，可以做进项抵扣，从而税收更接近实际经营情况，而小规模纳税人是根据税务机关核定情况缴纳的，因此它的税负一般都比较高，别看缴纳的税款不多，但是税负是相对高的。

简言之：你说的情况税收上时这样处理的，流转税，也就是增值税是根据业务量而收的，跟利润没关系，销售多缴税多，而所得税是利润高税收高，利润低税收低，所以税收在总体上时保持一个公平状态的。

问题补充 部分的回答：
小规模纳税人向一般纳税人销售货物时不是开具普通发票，而是到税务机关 增值税专用发票，而此销售的税款是由买货的一般纳税人缴纳的，而一般纳税人可将此税款做进项税额抵扣。所以不存在你说的重复征税问题。

对补充的补充的问题的回答：(也是最后一次回答)

首先不是所有的税种都是针对利润（你所说的利润率）收税的，你看下增值税的概念，他是针对销售量或者说销售金额征税的，所以叫流转税，而针对利润收的税是所得税，税法通过不同的税种对同一笔经营行为或者说对同一家企业的征收来做到不仅对流转行为征税而且对利润征税，流转税在征收的时候不考虑利润有所烧，而只是针对销售金额征税，而对利润高低的征收税种是由所得税来担任，

如果对增值税考虑利润率来分设不同税率，那还要所得税干嘛。

建议你首先看下流转税跟所得税的概念，然后回过头去再看我给你的答案，就知道你提的问题的答案了。

幸苦了那么久，你又没加分，一直认真的回答你的问题只是因为这是我的本行，尽力了，不要再问了。

可以这么来比较。
假设进价是a元（含税），加价率为r，故售价为（1+r）a/（1+17%）元。
一般纳税人负担的税额为 17%×[(1+r)a/（1+17%）-a]；
小规模纳税人负担的税额为 3%×（1+r）a；
令二者相等，即
3%×（1+r）a=17%×[(1+r)a/（1+17%）-a]，解得 r=47.4%，也就是说当利润率为47.4%时二者税负相当。当利润率超过47.4%时，小规模纳税人的税负会比较轻。
——这其实是有政府的政策考虑的。政府希望企业建立真实可靠的会计帐，才会对没有健全会计制度的小规模纳税人税负重的。而且因为没有健全的会计制度，小规模纳税人的销售额比较难核实，这又涉及到税收征管的问题了。
楼上说的也没错。还有一个所得税问题，来解决利润的。
补充的问题楼上的回答OK啦。