劳务派遣员工的薪资，由用工单位还是用人单位申报缴纳个人所得税？

劳务派遣员工的薪资是由用人单位申报个人所得税。
劳动派遣员工是与用人单位之间建立劳动关系，而不是用工单位。其薪资发放是由用人单位支付的，个税也是由用人单位代缴的。
劳务派遣员工与用工单位签订的劳务派遣用工协议，应当由用工单位向用人单位收取用工费用，按约定的部分支付给劳务派遣员工。则对用工单位来说，按全额确认收入，按支付给劳务派遣员工的为成本，增值税按差额征收，则劳务派遣员工的个税应当由用工单位申报个税。

扩展资料：
劳务派遣单位就是与被派遣员工签订劳动合同，建立劳动关系，承担《劳动法》上义务的用人单位。
劳务派遣单位虽然没有实际指挥被派遣员工进行劳动，而只是将 被派遣员工组织起来，统一管理，并根据用工单位的要求安排被派遣员工前往进行工作。
但是，由于劳务派遣单位实际与被派遣员工签订了劳动合同，建立了劳动关 系，在《劳动法》上，劳务派遣单位就是与被派遣员工相对的用人单位一方，并须依照《劳动法》和《劳动合同法》的规定对被派遣员工承担义务。
从劳动法的角度，应当由用工单位（即劳务公司）申报个税，根据劳动关系来确定

法律依据：《工资支付暂行规定》
第十五条　用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
(1)用人单位代扣代缴的个人所得税;
(2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;
(3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;
(4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
参考资料来源：工资支付暂行规定 -百度百科
参考资料来源：劳动法- 人民共和国政府网

根据《 人民共和国企业所得税法实施条例》三十四条的规定，企业发生的合理的工资薪金支出，准予在企业所得税税前扣除。
工资薪金，是指企业每一纳税年度支付给在本企业任职或者受雇的员工的所有现金形式或者非现金形式的劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪、加班工资，以及与员工任职或者受雇有关的其他支出。
但在实际操作中，人们认定企业员工的标准是与本企业签订劳动合同。对支付给签订劳动合同员工的基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪、加班工资等劳动报酬认定为工资薪金支出，并在应付职工薪酬会计科目上列支。
而对于支付给未与公司直接签订劳动合同的劳务派遣人员的劳务报酬，凭劳动派遣单位收到款项出具的劳务发票在业务及管理费——劳务费会计科目上列支。由用工单位直接支付的奖金、业务绩效、加班费和福利等直接入业务及管理费——销售费用等等科目。而在保险行业，对支付给劳务派遣人员的业务绩效，在“手续费及佣金支出”科目列支。
劳务派遣用工支出涉及税收有两项，一个是企业所得税前列支问题，另一个是个人所得税代扣代缴问题。根据《劳动合同法》第六十二条第(三)款规定，用工单位对劳务派遣人员有支付加班费、绩效奖金，提供与工作岗位相关的福利待遇的业务。但无论从用工单位还是税务部门在税收管理的实践看，认定用人单位与劳务派遣公司之间是购买劳务关系，支付给劳务公司费用属于劳务费用支出。
如果根据双方合同约定，由用人单位直接发放派遣人员加班费、奖金等支出，则属于企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，应准予在计算应纳税所得额时扣除。困惑的是，因4 其不是用工单位的职工，支付其劳动报酬不能作为本单位工资薪金在税前扣除，也不能作为三费的计算基数，只能作为劳务费用扣除。
而作为劳务费用扣除，又不能取得相应劳务派遣单位提供的发票。目前情况下，用工单位规避风险的办法是合同中约定由劳务派遣公司发放，劳务派遣公司开劳务费发票给用工单位在税前扣除。在个人所得税代扣代缴方面，劳务派遣人员适用“工资、薪金所得”还是“劳务报酬所得”项目缴纳个人所得税呢?根据《国家税务总局关于印发的(征收个人所得税若干问题的规定>通知》(国税发[1994]089号)第十九条“关于工资、薪金所得与劳务报酬所得的区分问题”规定：“工资、薪金所得是属于非独立个人劳务活动，即在机关、团体、学校、部队、企事业单位及其他组织中任职、受雇而得到的报酬，劳务报酬所得则是个人独立从事各种技艺、提供各项劳务取得的报酬。两者的主要区别在于，前者存在雇佣与被雇佣关系，后者则不存在这种关系。
虽然劳务派遣工与用工单位没有雇佣关系，但也不属于劳务派遣工个人独立提供劳务取得的报酬，现在一个单位的劳务派遣用工人数往往多于单位签订劳动合同人数，岗位也分布企业各个部门，包括管理部门。按《劳动合同法》要求，劳务派遣人员与劳务派出单位签订的是劳动合同，领取的劳动报酬肯定按工资薪金项目缴纳个人所得税。
而由用工单位直接支付的福利、绩效、加班费等，用工单位在会计科目上如果选择劳务费列支，则代扣代缴个人所得税按“劳务报酬所得”项目计算个人所得税又与劳务派出单位按“工资薪金所得”项目代扣代缴不一致；如按“工资薪金所得”项。

劳务派遣员工的薪资由用工单位还是用人单位申报缴纳个人所得税？
理论上来说，劳务派遣员工与用工单位（即劳务公司）签订的劳务派遣用工协议，应当由用工单位向用人单位收取用工费用，按约定的部分支付给劳务派遣员工，则对用工单位（即劳务公司）来说，按全额确认收入，按支付给劳务派遣员工的为成本，增值税按差额征收，则劳务派遣员工的个税应当由用工单位申报个税。用工单位凭用工单位（即劳务公司）开具的发票作为所得税前扣除的依据。
《劳动合同法》第58条明确规定，劳务派遣单位是《劳动合同法》所称用人单位。用工单位是《劳动合同法》中所指的接受派遣单位。
劳务派遣单位就是与被派遣员工签订劳动合同，建立劳动关系，承担《劳动法》上义务的用人单位。劳务派遣单位虽然没有实际指挥被派遣员工进行劳动，而只是将 被派遣员工组织起来，统一管理，并根据用工单位的要求安排被派遣员工前往进行工作。但是，由于劳务派遣单位实际与被派遣员工签订了劳动合同，建立了劳动关 系，在《劳动法》上，劳务派遣单位就是与被派遣员工相对的用人单位一方，并须依照《劳动法》和《劳动合同法》的规定对被派遣员工承担义务。
从劳动法的角度，应当由用工单位（即劳务公司）申报个税，根据劳动关系来确定。
但如果用人单位支付劳务派遣员工大部分薪酬，用工单位（即劳务公司）代收代缴劳务派遣员工五险一金，则存由谁申报劳务派遣员工的个税问题（及五险一金如何扣），以及用人单位的所得税前工资薪金扣除问题？
个人所得税法中规定，派遣单位和雇佣单位同时支付员工工资的，由雇佣单位扣生计费，正常申报，派遣单位不扣除费用申报，两个单位都需要申报，最后合并纳税调整。实际上员工的工资可以分为2块，一部分为代缴的社保，由劳务公司交，申报个税没问题，剩余部分在用工单位发，扣生计费，申报个税也没有问题，个税款计算是一致。

按道理是派遣单位，用工单位把钱打给派遣单位，不直接发给工作人员